把王在晋抬进内阁以后，后者不负所望，很快在奏疏中提出了第一条建议——针对举人、秀才、贡生出身士子的特权政策改动。
自明初以来，读书人获取功名后，就相当于阶层上的升级，成为和普通百姓截然不同的“上等人”。
他们的特权体现在很多个方面，但最主要的还是免除徭役和赋税，这两点太致命了。
王在晋建议，针对徭役方面，举人、秀才、贡生出身的士子仍可免力役、杂役，但不再免除兵役。
这也就是说，读书人存在会被卫所征为兵丁的可能。
赋税方面，废除全国两京贡生在赋税上的所有特权，秀才出身的士子免税土地仅限五亩，举人出身的士子免税土地改为二十亩。
拥有多余土地的士子，皆需正常交税，而且各省督办司都要陆续成立，不仅监察地方官商勾结，也要督办此事。
由于此事的特殊性，王在晋建议，督办司最好是让锦衣卫负责，隶属于镇抚司。
对这些大胆的提议，朱由校全部准奏。
辽东方面，熊廷弼握着大权，在将辽沈地区的蒙古难民、建州降人彻底清除以后，便下令不再接收降人。
十二月底，熊廷弼的奏疏到了京师，内容是努尔哈赤蠢蠢欲动，后金兵力正在集结，表示会与辽阳城共存亡。
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